Protein–RNA interactions for Protein: O60637

TSPAN3, Tetraspanin-3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3O60637 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.91□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TSPAN3O60637 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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TSPAN3O60637 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TSPAN3O60637 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
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TSPAN3O60637 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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TSPAN3O60637 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TSPAN3O60637 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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TSPAN3O60637 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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TSPAN3O60637 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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TSPAN3O60637 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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TSPAN3O60637 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TSPAN3O60637 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TSPAN3O60637 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TSPAN3O60637 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
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TSPAN3O60637 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TSPAN3O60637 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TSPAN3O60637 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TSPAN3O60637 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TSPAN3O60637 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TSPAN3O60637 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TSPAN3O60637 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TSPAN3O60637 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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TSPAN3O60637 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TSPAN3O60637 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TSPAN3O60637 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TSPAN3O60637 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
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