Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.51□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
HTATSF1O43719 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
HTATSF1O43719 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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