Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SH3BP4Q9P0V3 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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