Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.41□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LHX9Q9NQ69 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LHX9Q9NQ69 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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