Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXD1Q9GZZ0 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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