Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Q1T7F1 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Q1T7F1 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Q1T7F1 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Q1T7F1 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Q1T7F1 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Q1T7F1 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Q1T7F1 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Q1T7F1 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Q1T7F1 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Q1T7F1 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Q1T7F1 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Q1T7F1 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Q1T7F1 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Q1T7F1 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Q1T7F1 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Q1T7F1 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Q1T7F1 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Q1T7F1 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Q1T7F1 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Q1T7F1 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Q1T7F1 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Q1T7F1 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Q1T7F1 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Q1T7F1 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Q1T7F1 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Q1T7F1 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Q1T7F1 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Q1T7F1 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Q1T7F1 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Q1T7F1 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Q1T7F1 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Q1T7F1 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Q1T7F1 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Q1T7F1 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Q1T7F1 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Q1T7F1 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Q1T7F1 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Q1T7F1 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Q1T7F1 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Q1T7F1 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Q1T7F1 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Q1T7F1 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Q1T7F1 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Q1T7F1 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Q1T7F1 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Q1T7F1 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Q1T7F1 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Q1T7F1 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Q1T7F1 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Q1T7F1 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Q1T7F1 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Q1T7F1 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
Q1T7F1 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Q1T7F1 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Q1T7F1 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Q1T7F1 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Q1T7F1 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Q1T7F1 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Q1T7F1 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
Q1T7F1 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Q1T7F1 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Q1T7F1 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
Q1T7F1 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Q1T7F1 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Q1T7F1 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Q1T7F1 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Q1T7F1 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Q1T7F1 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Q1T7F1 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Q1T7F1 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Q1T7F1 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Q1T7F1 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Q1T7F1 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Q1T7F1 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Q1T7F1 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Q1T7F1 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Q1T7F1 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Q1T7F1 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Q1T7F1 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Q1T7F1 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Q1T7F1 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Q1T7F1 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Q1T7F1 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Q1T7F1 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Q1T7F1 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Q1T7F1 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Q1T7F1 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
Q1T7F1 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Q1T7F1 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Q1T7F1 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
Q1T7F1 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.6□□□□□ -2.51
Q1T7F1 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
Q1T7F1 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Q1T7F1 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Q1T7F1 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Q1T7F1 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Q1T7F1 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Q1T7F1 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
Q1T7F1 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
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