Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
KNOP1Q1ED39 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
KNOP1Q1ED39 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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