Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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BRD3Q15059 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
BRD3Q15059 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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BRD3Q15059 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
BRD3Q15059 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
BRD3Q15059 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
BRD3Q15059 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
BRD3Q15059 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
BRD3Q15059 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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BRD3Q15059 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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BRD3Q15059 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
BRD3Q15059 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
BRD3Q15059 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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BRD3Q15059 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
BRD3Q15059 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
BRD3Q15059 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
BRD3Q15059 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
BRD3Q15059 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
BRD3Q15059 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
BRD3Q15059 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
BRD3Q15059 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
BRD3Q15059 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
BRD3Q15059 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
BRD3Q15059 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
BRD3Q15059 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
BRD3Q15059 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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BRD3Q15059 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
BRD3Q15059 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
BRD3Q15059 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
BRD3Q15059 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
BRD3Q15059 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
BRD3Q15059 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
BRD3Q15059 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
BRD3Q15059 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
BRD3Q15059 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
BRD3Q15059 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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