Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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HERPUD1Q15011 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERPUD1Q15011 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
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