Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.7□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
CHD4Q14839 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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