Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
GBX1Q14549 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 819.8 ms