Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
CKAP5Q14008 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CKAP5Q14008 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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