Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
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CDH18Q13634 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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CDH18Q13634 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
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CDH18Q13634 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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CDH18Q13634 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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CDH18Q13634 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
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CDH18Q13634 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CDH18Q13634 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CDH18Q13634 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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