Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PRPF4BQ13523 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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