Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
MRPL49Q13405 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MRPL49Q13405 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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