Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTP4A2Q12974 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTP4A2Q12974 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTP4A2Q12974 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTP4A2Q12974 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTP4A2Q12974 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTP4A2Q12974 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTP4A2Q12974 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
PTP4A2Q12974 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTP4A2Q12974 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTP4A2Q12974 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTP4A2Q12974 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTP4A2Q12974 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTP4A2Q12974 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTP4A2Q12974 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTP4A2Q12974 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
PTP4A2Q12974 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTP4A2Q12974 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTP4A2Q12974 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTP4A2Q12974 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTP4A2Q12974 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTP4A2Q12974 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTP4A2Q12974 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTP4A2Q12974 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTP4A2Q12974 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTP4A2Q12974 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTP4A2Q12974 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTP4A2Q12974 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTP4A2Q12974 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PTP4A2Q12974 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.5 ms