Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.64□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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GTF3C1Q12789 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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GTF3C1Q12789 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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GTF3C1Q12789 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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