Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

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Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ZNF543Q08ER8 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF543Q08ER8 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF543Q08ER8 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF543Q08ER8 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF543Q08ER8 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF543Q08ER8 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ZNF543Q08ER8 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF543Q08ER8 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF543Q08ER8 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF543Q08ER8 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF543Q08ER8 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF543Q08ER8 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF543Q08ER8 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZNF543Q08ER8 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF543Q08ER8 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF543Q08ER8 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZNF543Q08ER8 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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