Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
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RABGGTBP53611 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RABGGTBP53611 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
RABGGTBP53611 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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