Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PTPRMP28827 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
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PTPRMP28827 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
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PTPRMP28827 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
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PTPRMP28827 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
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PTPRMP28827 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PTPRMP28827 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-1.55□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PTPRMP28827 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
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