Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
LRRTM2O43300 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.71□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
LRRTM2O43300 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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