Protein–RNA interactions for Protein: O14493

CLDN4, Claudin-4, humanhuman

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN4O14493 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
CLDN4O14493 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CLDN4O14493 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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