Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
B4DXG7 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
B4DXG7 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
B4DXG7 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
B4DXG7 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
B4DXG7 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
B4DXG7 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
B4DXG7 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
B4DXG7 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
B4DXG7 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
B4DXG7 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
B4DXG7 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
B4DXG7 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
B4DXG7 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
B4DXG7 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
B4DXG7 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
B4DXG7 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
B4DXG7 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
B4DXG7 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
B4DXG7 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
B4DXG7 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
B4DXG7 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
B4DXG7 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
B4DXG7 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
B4DXG7 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
B4DXG7 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
B4DXG7 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
B4DXG7 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
B4DXG7 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
B4DXG7 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
B4DXG7 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
B4DXG7 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
B4DXG7 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
B4DXG7 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
B4DXG7 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
B4DXG7 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
B4DXG7 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
B4DXG7 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
B4DXG7 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
B4DXG7 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
B4DXG7 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
B4DXG7 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
B4DXG7 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
B4DXG7 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
B4DXG7 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
B4DXG7 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
B4DXG7 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
B4DXG7 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
B4DXG7 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
B4DXG7 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
B4DXG7 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
B4DXG7 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
B4DXG7 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
B4DXG7 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
B4DXG7 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
B4DXG7 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
B4DXG7 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
B4DXG7 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
B4DXG7 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
B4DXG7 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
B4DXG7 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
B4DXG7 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
B4DXG7 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
B4DXG7 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
B4DXG7 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
B4DXG7 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
B4DXG7 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
B4DXG7 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
B4DXG7 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
B4DXG7 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
B4DXG7 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
B4DXG7 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
B4DXG7 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
B4DXG7 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
B4DXG7 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
B4DXG7 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
B4DXG7 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
B4DXG7 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
B4DXG7 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
B4DXG7 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
B4DXG7 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
B4DXG7 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
B4DXG7 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
B4DXG7 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
B4DXG7 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
B4DXG7 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
B4DXG7 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
B4DXG7 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
B4DXG7 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
B4DXG7 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
B4DXG7 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
B4DXG7 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
B4DXG7 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
B4DXG7 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
B4DXG7 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
B4DXG7 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
B4DXG7 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
B4DXG7 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
B4DXG7 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
B4DXG7 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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