Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
VAX2Q9UIW0 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.25□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
VAX2Q9UIW0 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.3 ms