Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CLN8Q9UBY8 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CLN8Q9UBY8 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CLN8Q9UBY8 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CLN8Q9UBY8 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CLN8Q9UBY8 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CLN8Q9UBY8 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CLN8Q9UBY8 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLN8Q9UBY8 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLN8Q9UBY8 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLN8Q9UBY8 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLN8Q9UBY8 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLN8Q9UBY8 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLN8Q9UBY8 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLN8Q9UBY8 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLN8Q9UBY8 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLN8Q9UBY8 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLN8Q9UBY8 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLN8Q9UBY8 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLN8Q9UBY8 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLN8Q9UBY8 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CLN8Q9UBY8 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.5 ms