Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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RRN3Q9NYV6 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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RRN3Q9NYV6 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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RRN3Q9NYV6 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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RRN3Q9NYV6 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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RRN3Q9NYV6 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RRN3Q9NYV6 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
RRN3Q9NYV6 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
RRN3Q9NYV6 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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RRN3Q9NYV6 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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