Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms