Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
GINS3Q9BRX5 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
GINS3Q9BRX5 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
GINS3Q9BRX5 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
GINS3Q9BRX5 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
GINS3Q9BRX5 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
GINS3Q9BRX5 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
GINS3Q9BRX5 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
GINS3Q9BRX5 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
GINS3Q9BRX5 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-1.45□□□□□ -2.64
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
GINS3Q9BRX5 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
GINS3Q9BRX5 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
GINS3Q9BRX5 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
GINS3Q9BRX5 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GINS3Q9BRX5 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GINS3Q9BRX5 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GINS3Q9BRX5 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GINS3Q9BRX5 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GINS3Q9BRX5 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GINS3Q9BRX5 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GINS3Q9BRX5 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GINS3Q9BRX5 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GINS3Q9BRX5 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GINS3Q9BRX5 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GINS3Q9BRX5 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GINS3Q9BRX5 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC-1.49□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.5□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.52□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
GINS3Q9BRX5 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
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