Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RBBP8Q99708 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RBBP8Q99708 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms