Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
ARXQ96QS3 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ARXQ96QS3 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ARXQ96QS3 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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