Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
TRAPPC9Q96Q05 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRAPPC9Q96Q05 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms