Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
SYDE1Q6ZW31 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYDE1Q6ZW31 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYDE1Q6ZW31 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYDE1Q6ZW31 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYDE1Q6ZW31 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYDE1Q6ZW31 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYDE1Q6ZW31 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYDE1Q6ZW31 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYDE1Q6ZW31 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYDE1Q6ZW31 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYDE1Q6ZW31 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYDE1Q6ZW31 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SYDE1Q6ZW31 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SYDE1Q6ZW31 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYDE1Q6ZW31 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYDE1Q6ZW31 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYDE1Q6ZW31 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYDE1Q6ZW31 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYDE1Q6ZW31 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYDE1Q6ZW31 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYDE1Q6ZW31 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYDE1Q6ZW31 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYDE1Q6ZW31 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SYDE1Q6ZW31 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SYDE1Q6ZW31 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SYDE1Q6ZW31 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SYDE1Q6ZW31 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SYDE1Q6ZW31 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SYDE1Q6ZW31 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SYDE1Q6ZW31 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.7 ms