Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PTPN21Q16825 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPN21Q16825 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPN21Q16825 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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