Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
RPE65Q16518 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
RPE65Q16518 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPE65Q16518 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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