Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
USF2Q15853 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
USF2Q15853 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
USF2Q15853 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
USF2Q15853 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
USF2Q15853 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
USF2Q15853 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
USF2Q15853 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
USF2Q15853 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
USF2Q15853 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
USF2Q15853 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
USF2Q15853 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
USF2Q15853 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
USF2Q15853 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
USF2Q15853 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
USF2Q15853 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
USF2Q15853 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
USF2Q15853 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
USF2Q15853 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
USF2Q15853 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
USF2Q15853 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
USF2Q15853 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
USF2Q15853 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
USF2Q15853 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
USF2Q15853 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
USF2Q15853 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
USF2Q15853 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
USF2Q15853 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
USF2Q15853 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
USF2Q15853 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
USF2Q15853 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
USF2Q15853 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
USF2Q15853 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.5
USF2Q15853 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
USF2Q15853 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
USF2Q15853 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
USF2Q15853 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
USF2Q15853 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
USF2Q15853 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
USF2Q15853 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
USF2Q15853 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
USF2Q15853 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
USF2Q15853 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
USF2Q15853 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
USF2Q15853 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
USF2Q15853 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
USF2Q15853 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
USF2Q15853 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
USF2Q15853 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
USF2Q15853 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
USF2Q15853 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
USF2Q15853 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
USF2Q15853 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
USF2Q15853 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
USF2Q15853 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
USF2Q15853 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
USF2Q15853 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
USF2Q15853 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
USF2Q15853 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
USF2Q15853 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
USF2Q15853 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
USF2Q15853 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
USF2Q15853 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
USF2Q15853 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
USF2Q15853 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
USF2Q15853 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
USF2Q15853 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
USF2Q15853 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
USF2Q15853 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
USF2Q15853 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
USF2Q15853 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
USF2Q15853 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
USF2Q15853 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
USF2Q15853 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
USF2Q15853 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
USF2Q15853 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
USF2Q15853 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
USF2Q15853 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
USF2Q15853 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
USF2Q15853 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
USF2Q15853 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
USF2Q15853 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
USF2Q15853 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
USF2Q15853 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
USF2Q15853 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
USF2Q15853 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
USF2Q15853 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
USF2Q15853 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
USF2Q15853 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
USF2Q15853 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
USF2Q15853 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
USF2Q15853 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
USF2Q15853 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
USF2Q15853 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
USF2Q15853 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
USF2Q15853 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
USF2Q15853 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
USF2Q15853 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
USF2Q15853 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
USF2Q15853 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
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