Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC1□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
BRD3Q15059 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
BRD3Q15059 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms