Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HERPUD1Q15011 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.63□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HERPUD1Q15011 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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