Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RFTN1Q14699 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RFTN1Q14699 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms