Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
NEDD9Q14511 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NEDD9Q14511 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NEDD9Q14511 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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