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Protein–RNA interactions for Protein: Q13620
CUL4B, Cullin-4B, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CUL4B
Q13620
AL391516.1-201
ENST00000554380
2449 nt
BASIC
1.15
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
CXADR-202
ENST00000356275
270 nt
TSL 1 (best)
BASIC
1.15
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
Y_RNA.233-201
ENST00000364407
101 nt
BASIC
1.15
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
SNORD114-24-201
ENST00000365029
72 nt
BASIC
1.15
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
Y_RNA.327-201
ENST00000365201
102 nt
BASIC
1.15
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
SNORD111-201
ENST00000408139
94 nt
BASIC
1.15
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
MIR377-201
ENST00000362145
69 nt
BASIC
1.14
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
SNORA25.7-201
ENST00000364375
127 nt
BASIC
1.14
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
SNORD113.3-201
ENST00000364630
78 nt
BASIC
1.14
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
RNU6-597P-201
ENST00000365620
102 nt
BASIC
1.14
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
Y_RNA.454-201
ENST00000384224
113 nt
BASIC
1.14
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
RNA5SP127-201
ENST00000411051
133 nt
BASIC
1.14
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
TRMT112P2-201
ENST00000512910
132 nt
BASIC
1.14
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
MIR4295-201
ENST00000585286
85 nt
BASIC
1.14
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
AC103810.9-201
ENST00000606688
112 nt
BASIC
1.14
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
MIR8055-201
ENST00000610739
97 nt
BASIC
1.14
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
AC106800.4-201
ENST00000614905
153 nt
BASIC
1.14
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
AC012676.2-201
ENST00000619258
186 nt
BASIC
1.14
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
ANGPTL3-201
ENST00000371129
2805 nt
APPRIS P1
TSL 1 (best)
BASIC
1.13
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
Y_RNA.257-201
ENST00000364596
102 nt
BASIC
1.13
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
MIR624-201
ENST00000385217
97 nt
BASIC
1.13
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
RNU6-321P-201
ENST00000410912
106 nt
BASIC
1.13
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
Y_RNA.793-201
ENST00000411222
111 nt
BASIC
1.13
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
AC078980.1-201
ENST00000485384
262 nt
TSL 2
BASIC
1.13
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
AC005840.1-201
ENST00000498412
377 nt
BASIC
1.13
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
AC036111.3-201
ENST00000526389
112 nt
BASIC
1.13
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
MIR4264-201
ENST00000583520
66 nt
BASIC
1.13
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
AC131055.1-201
ENST00000584626
316 nt
BASIC
1.13
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
HSPE1P19-201
ENST00000603327
295 nt
BASIC
1.13
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
AP000753.3-201
ENST00000604083
169 nt
BASIC
1.13
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
Z97988.1-201
ENST00000637697
135 nt
BASIC
1.13
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
MIR337-201
ENST00000362281
93 nt
BASIC
1.12
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
Y_RNA.168-201
ENST00000363740
102 nt
BASIC
1.12
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
RNU4-38P-201
ENST00000364472
129 nt
BASIC
1.12
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
Y_RNA.351-201
ENST00000365436
96 nt
BASIC
1.12
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
AC006461.1-201
ENST00000412637
326 nt
BASIC
1.12
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
FABP5P4-201
ENST00000437203
171 nt
BASIC
1.12
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
DIP2A-IT1-201
ENST00000442434
428 nt
TSL 2
BASIC
1.12
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
RNU2-11P-201
ENST00000459191
187 nt
BASIC
1.12
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
AC087343.1-201
ENST00000477341
475 nt
BASIC
1.12
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
AC010177.1-201
ENST00000547819
366 nt
TSL 3
BASIC
1.12
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
RNY1P10-201
ENST00000363268
113 nt
BASIC
1.11
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
RNU6-580P-201
ENST00000365159
107 nt
BASIC
1.11
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
RNU6-913P-201
ENST00000390913
95 nt
BASIC
1.11
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
MIR548I3-201
ENST00000408378
149 nt
BASIC
1.11
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
RNA5SP261-201
ENST00000410536
106 nt
BASIC
1.11
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
AC107027.2-201
ENST00000512197
115 nt
BASIC
1.11
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
RNU6-138P-201
ENST00000515952
107 nt
BASIC
1.11
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
AP002392.1-201
ENST00000537692
208 nt
BASIC
1.11
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
MIR4781-201
ENST00000585250
76 nt
BASIC
1.11
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
AL020996.3-201
ENST00000606617
222 nt
BASIC
1.11
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
MIR302B-201
ENST00000362188
73 nt
BASIC
1.1
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
Y_RNA.29-201
ENST00000362570
113 nt
BASIC
1.1
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
RNU6-654P-201
ENST00000364373
107 nt
BASIC
1.1
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
Y_RNA.785-201
ENST00000384290
109 nt
BASIC
1.1
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
Y_RNA.521-201
ENST00000384560
114 nt
BASIC
1.1
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
SNORD38B-201
ENST00000384690
67 nt
BASIC
1.1
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
SNORD124-201
ENST00000459577
104 nt
BASIC
1.1
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
RNU6-1219P-201
ENST00000516143
112 nt
BASIC
1.1
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
AC023827.1-201
ENST00000569247
97 nt
BASIC
1.1
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
MIR4661-201
ENST00000582720
75 nt
BASIC
1.1
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
AC091895.1-201
ENST00000624494
256 nt
BASIC
1.1
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
SNORD38B-202
ENST00000625943
69 nt
BASIC
1.1
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
MIR376A2-201
ENST00000636782
80 nt
BASIC
1.1
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
SNORA1.1-201
ENST00000364671
133 nt
BASIC
1.09
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
Y_RNA.337-201
ENST00000365312
102 nt
BASIC
1.09
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
Y_RNA.393-201
ENST00000383936
102 nt
BASIC
1.09
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
RNU6-125P-201
ENST00000384505
107 nt
BASIC
1.09
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
RNU7-120P-201
ENST00000459334
63 nt
BASIC
1.09
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
UBL5P1-201
ENST00000507979
193 nt
BASIC
1.09
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
DLEU2_5.2-201
ENST00000610606
84 nt
BASIC
1.09
□□□□□ -2.23
CUL4B
Q13620
RNU6-392P-201
ENST00000364926
101 nt
BASIC
1.08
□□□□□ -2.24
CUL4B
Q13620
Y_RNA.357-201
ENST00000365487
109 nt
BASIC
1.08
□□□□□ -2.24
CUL4B
Q13620
SNORA2B-201
ENST00000384583
137 nt
BASIC
1.08
□□□□□ -2.24
CUL4B
Q13620
MIR942-201
ENST00000401111
86 nt
BASIC
1.08
□□□□□ -2.24
CUL4B
Q13620
RNU7-70P-201
ENST00000516941
66 nt
BASIC
1.08
□□□□□ -2.24
CUL4B
Q13620
IGHVIII-67-2-201
ENST00000519849
88 nt
BASIC
1.08
□□□□□ -2.24
CUL4B
Q13620
Y_RNA.240-201
ENST00000364469
95 nt
BASIC
1.07
□□□□□ -2.24
CUL4B
Q13620
RNU6-1187P-201
ENST00000364771
110 nt
BASIC
1.07
□□□□□ -2.24
CUL4B
Q13620
Y_RNA.354-201
ENST00000365448
111 nt
BASIC
1.07
□□□□□ -2.24
CUL4B
Q13620
AC092892.1-201
ENST00000496067
327 nt
TSL 5
BASIC
1.07
□□□□□ -2.24
CUL4B
Q13620
AC004148.1-201
ENST00000571506
398 nt
TSL 5
BASIC
1.07
□□□□□ -2.24
CUL4B
Q13620
AC091932.4-201
ENST00000623386
200 nt
BASIC
1.07
□□□□□ -2.24
CUL4B
Q13620
MIR342-201
ENST00000362212
99 nt
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
CUL4B
Q13620
RNU6-239P-201
ENST00000390990
99 nt
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
CUL4B
Q13620
AC090844.1-201
ENST00000422019
156 nt
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
CUL4B
Q13620
AC244023.1-201
ENST00000426884
112 nt
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
CUL4B
Q13620
SEPT7P4-201
ENST00000437076
306 nt
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
CUL4B
Q13620
AC067940.1-201
ENST00000458411
300 nt
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
CUL4B
Q13620
U7.7-201
ENST00000459276
60 nt
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
CUL4B
Q13620
SNORA81.3-201
ENST00000517283
198 nt
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
CUL4B
Q13620
AC022559.1-201
ENST00000520905
205 nt
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
CUL4B
Q13620
MIR3152-201
ENST00000579801
74 nt
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
CUL4B
Q13620
AC242498.1-201
ENST00000604134
111 nt
BASIC
1.06
□□□□□ -2.24
CUL4B
Q13620
Y_RNA.4-201
ENST00000362333
112 nt
BASIC
1.05
□□□□□ -2.24
CUL4B
Q13620
Y_RNA.164-201
ENST00000363709
102 nt
BASIC
1.05
□□□□□ -2.24
CUL4B
Q13620
RPS3AP1-201
ENST00000413190
320 nt
BASIC
1.05
□□□□□ -2.24
CUL4B
Q13620
PDCD5P2-201
ENST00000507570
312 nt
BASIC
1.05
□□□□□ -2.24
CUL4B
Q13620
SCARNA15-202
ENST00000516881
127 nt
BASIC
1.05
□□□□□ -2.24
CUL4B
Q13620
MIR3646-201
ENST00000578301
84 nt
BASIC
1.05
□□□□□ -2.24
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