Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRPF4BQ13523 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
PRPF4BQ13523 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRPF4BQ13523 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRPF4BQ13523 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRPF4BQ13523 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRPF4BQ13523 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRPF4BQ13523 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRPF4BQ13523 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRPF4BQ13523 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRPF4BQ13523 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRPF4BQ13523 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRPF4BQ13523 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRPF4BQ13523 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PRPF4BQ13523 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF4BQ13523 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PRPF4BQ13523 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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