Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SF3B2Q13435 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SF3B2Q13435 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SF3B2Q13435 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SF3B2Q13435 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SF3B2Q13435 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SF3B2Q13435 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SF3B2Q13435 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SF3B2Q13435 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF3B2Q13435 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF3B2Q13435 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF3B2Q13435 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF3B2Q13435 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF3B2Q13435 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF3B2Q13435 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SF3B2Q13435 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SF3B2Q13435 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SF3B2Q13435 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SF3B2Q13435 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SF3B2Q13435 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SF3B2Q13435 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SF3B2Q13435 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SF3B2Q13435 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SF3B2Q13435 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SF3B2Q13435 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SF3B2Q13435 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SF3B2Q13435 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SF3B2Q13435 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SF3B2Q13435 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SF3B2Q13435 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SF3B2Q13435 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SF3B2Q13435 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SF3B2Q13435 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SF3B2Q13435 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SF3B2Q13435 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SF3B2Q13435 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SF3B2Q13435 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SF3B2Q13435 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SF3B2Q13435 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SF3B2Q13435 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SF3B2Q13435 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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