Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SKP2Q13309 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SKP2Q13309 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms