Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
CHAF1AQ13111 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CHAF1AQ13111 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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