Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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IFT88Q13099 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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IFT88Q13099 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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IFT88Q13099 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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IFT88Q13099 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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IFT88Q13099 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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IFT88Q13099 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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IFT88Q13099 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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IFT88Q13099 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
IFT88Q13099 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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