Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GPS1Q13098 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GPS1Q13098 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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