Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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TRAF1Q13077 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TRAF1Q13077 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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TRAF1Q13077 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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TRAF1Q13077 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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TRAF1Q13077 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TRAF1Q13077 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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