Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDC20Q12834 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDC20Q12834 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDC20Q12834 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDC20Q12834 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDC20Q12834 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDC20Q12834 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CDC20Q12834 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CDC20Q12834 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.9 ms