Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHRNEQ04844 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHRNEQ04844 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 557.2 ms