Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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PGGT1BP53609 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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PGGT1BP53609 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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PGGT1BP53609 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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PGGT1BP53609 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PGGT1BP53609 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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PGGT1BP53609 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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PGGT1BP53609 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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PGGT1BP53609 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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PGGT1BP53609 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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PGGT1BP53609 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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PGGT1BP53609 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PGGT1BP53609 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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